La Universidad de San José fue aprobada por el Consejo Nacional de Educación Superior Universitaria Privada (CONESUP), órgano adscrito al Ministerio de Educación de Costa Rica, el día 17 de setiembre de 1992. La Universidad cumple veintitrés años de creada, la experiencia en el campo de la educación superior universitaria privada data de 1976, cuando se inició como un colegio universitario afiliado a la Universidad Autónoma de Centroamérica.
La USJ es una institución de educación superior privada, constituida por una comunidad interactiva de estudiantes, con cuerpo educativo y personal administrativo.
